r语言学习免疫浸润分析1

肿瘤免疫相关网页工具/数据库

2020-03-29  本文已影响0人  Steven潘

这份提纲是为了《医学信息学》这门课的期末presentation准备的。因为自己前期收藏了一些数据分析的网页工具,所以就顺手整理了一下,和大伙儿分享。挂一漏万,欢迎补充。

肿瘤免疫

The Cancer Immunome Atlas (TCIA)

Tumor Immune Estimation Resource (TIMER)

肿瘤

cBioPortal for Cancer Genomics

OncoLnc

Cistrome Cancer

Tumor suppressor gene database (TSGene)

Network of Cancer Genes

免疫

10,000 Immunomes Project

InnateDB

Immport

Immunome Database

ImmuneSigDB

ImmGen

Immunogenetic Related Information Source (IRIS)

细胞

CellMarker

Ligand Receptor Connectome

正常组组基因表达

GTEx Portal

ARCHS4

通路

GSEA | MSigDB

GSKB

Gene Ontology Resource

KEGG

Reactome

转录调控

TFmapper

ChEA3

JASPAR - a database of transcription factor binding profiles

TRRUST - Transcriptional Regulatory Relationships Unraveled by Sentence-based Text mining

oPOSSUM 3.0 Home

其他

STRING

BioGrid

BioMart

InterPro

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