目录

R语言之可视化①误差棒

R语言之可视化②点图

R语言之可视化③点图续

R语言之可视化④点韦恩图upsetR

R语言之可视化⑤R图形系统

R语言之可视化⑥R图形系统续

R语言之可视化⑦easyGgplot2散点图

R语言之可视化⑧easyGgplot2散点图续

R语言之可视化⑨火山图

R语言之可视化⑩坐标系统

R语言之可视化①①热图绘制heatmap

R语言之可视化①②热图绘制2

R语言之可视化①③散点图+拟合曲线

R语言之可视化①④一页多图（1）

R语言之可视化①⑤ROC曲线

R语言之可视化①⑥一页多图（2）

R语言之可视化①⑦调色板

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正文

install.packages("RColorBrewer")
library(RColorBrewer)
display.brewer.all()

• 连续型调色板（第一个颜色列表），适用于从低到高（梯度）的有序数据。 调色板名称是：Blues，BuGn，BuPu，GnBu，Greens，Grays，Oranges，OrRd，PuBu，PuBuGn，PuRd，Purples，RdPu，Reds，YlGn，YlGnBu YlOrBr，YlOrRd。

• 定性调色板（第二种颜色列表），最适合表示名义或分类数据。 它们并不意味着群体之间的巨大差异。 调色板名称为：Accent，Dark2，Paired，Pastel1，Pastel2，Set1，Set2，Set3。

• 差异调色板（第三种颜色列表），强调数据范围两端颜色相反。 分散的调色板是：BrBG，PiYG，PRGn，PuOr，RdBu，RdGy，RdYlBu，RdYlGn，Spectral

这个包甚至可以提动专门为色盲提供的颜色表

• 仅显示色盲友好的调色板
  要仅显示色盲友好的brewer调色板，请指定colorblindFriendly选项= TRUE，如下所示：

display.brewer.all(colorblindFriendly = TRUE)

# 1. Visualize a single RColorBrewer palette 
# by specifying its name
display.brewer.pal(n, name)

# 2. Return the hexadecimal color code of the palette
brewer.pal(n, name)

函数参数的描述：
n：调色板中不同颜色的数量，最小值为3，最大值取决于调色板。
name：上面列表中的调色板名称。 例如name = RdBu。
以下R代码演示了如何显示一个单一的r颜色brewer调色板。

# View a single RColorBrewer palette by specifying its name
display.brewer.pal(n = 8, name = 'Dark2')
# Hexadecimal color specification 
brewer.pal(n = 8, name = "Dark2")

[1] "#1B9E77" "#D95F02" "#7570B3" "#E7298A" "#66A61E" "#E6AB02" "#A6761D"## [8] "#666666"

• 在ggplot2中使用RColorBrewer调色板
  创建一个由组着色的基本ggplot，使用iris演示数据集创建基本ggplots。 我们将创建两组不同颜色的图：散点图和箱形图。

library("ggplot2")
# Box plot: changing the fill color by Species
bp <- ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) + 
  geom_boxplot(aes(fill = Species)) +
  theme_minimal() +
  theme(legend.position = "top")
bp

# Scatter plot: changing points color by Species
sp <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Sepal.Width)) + 
  geom_point(aes(color = Species)) +
  theme_minimal()+
  theme(legend.position = "top")
sp

• 使用r color brewer palettes更改ggplot组颜色

ggplot2中提供了两种色标功能，用于使用rcolorbrewer调色板：
scale_fill_brewer（）用于箱形图，条形图，小提琴图，点图等
scale_color_brewer（）用于行和点

# Box plot
bp + scale_fill_brewer(palette = "Dark2")

# Scatter plot
sp + scale_color_brewer(palette = "Dark2")

image.png

在基础图中使用RColorBrewer调色板，brewer.pal（）函数用于生成颜色矢量。

# Barplot using RColorBrewer
barplot(c(2,5,7), col = brewer.pal(n = 3, name = "RdBu"))