linux环境下的软件安装

1、如何下载miniconda

• 百度/谷歌搜索“miniconda 清华”,进入“清华大学开源软件镜像站”
• 输入命令“ uname -a”安装最新版本
• 输入命令“cd ~/biosoft”进入biosoft目录，将软件下载到这里
• 输入命令“wget 链接”进行下载
• 输入命令“bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh”进行安装
• 输入命令“source ~/.bashrc”来激活conda
• 输入命令“conda”出现满屏信息说明安装完成

2、使用conda

1. 命令“conda list”：查看当前服务器上安装的所有软件列表
2. 命令“conda search fastqc”：搜索conda软件
3. 命令“conda install fastqc -y”：安装软件
4. 命令“conda remove fastqc -y”：卸载软件
5. 命令“conda info --envs”：查看当前conda有那些环境
6. 命令“conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y”：建立一个名叫rnaseq的conda环境，然后指定python版本是3
7. 命令“conda info --envs”：再次查看一下我们的conda环境
8. 命令“conda deactivate ”：退出当前环境