第二天

20190725

今天学习 官网的细胞周期的得分与回归

Cell-Cycle Scoring and Regression

原网站https://satijalab.org/seurat/v3.0/cell_cycle_vignette.html

文中写道需要下载新的一个文件，对此文件进行seurat的对象进行处理。

并且我发现很多时候做分析都说了不能影响下游分析

Assign Cell-Cycle Scores

在细胞周期分配得分时,采用的方法是：使用了G2M和S阶段的定量评分

而并没采用离散分法

可是花细胞周期分布的时候，要注明是哪个细胞的（具体就要看个人的生物医学背景了）

对于细胞之间的异质性，在版本1.4是单独的一个函数，现在合并到lScaleData这个函数中

在每次做PCA时会根据需求调整features这个参数