目录

R语言之生信①差异基因分析1

R语言之生信②差异基因分析2

R语言之生信③差异基因分析3

R语言之生信④TCGA生存分析1

R语言之生信⑤TCGA生存分析2

R语言之生信⑥TCGA生存分析3

R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)

R语言之生信⑧Cox比例风险模型(多因素)

R语言之生信（9）R语言多个生存分析曲线比较

R语言之生信（10）多个探针对应一个基因的处理方法

R语言之生信（11）五分钟学会用R语言构建ceRNA网络

R语言之生信（12）一分钟学会绘制cox/meta森林图

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一般我们做生信的单因素或者多因素cox分析时，都会制作一个三线表，如下图所示：

这一类三线表的数据来源和如何绘制，在我前期的视频中已经做过了。有兴趣的可有看一下R语言与生信系列①R入门与临床三线表绘制。但是我们有时需要绘制稍微高级一点，或者说是美观一点的森林图来替换三线表。比如下图

这一类的森林图与三线表的区别就是，将HR值及其可信区间用点和线段绘画出来。当然这类图不仅可以用于单因素或者多因素cox分析的绘制，更多的人将其应用于meta分析，如下图

实战

• 读取数据

setwd('D:\\train\\forest')
library(forestplot)
cox_forest <- read.csv('cox.csv',header = F)

• 绘制森林图