grep
2021-05-22 本文已影响0人
MLD_TRNA
参考：http://man.linuxde.net/grep
1.grep命令
(1)查找genome.txt中的RNA有多少个
</article>
grep RNA genome.txt |wc
(2)打印出genome.txt中以#开头的行
grep '^#' genome.txt
(3)不打印出genome.txt中以#开头的行
grep -v '^#' genome.txt
(4)精确查找并计数
grep -w SRR2345 genome.txt |wc
（5）提取特定字符串前后多少行（字符串所在行算作一行）
grep -A|B n "key" file
#A和B可以分别出现-A 10 | -B 10
A：表示在字符串之后 after context
B：表示在字符串之前 before context
n：要获取多少行文本 line number
key：为要查找的字符串
file：文件名
例如
grep -A 2 "id" go-basic.obo
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