使用Maxent最大熵模型模拟物种适生区操作步骤
1.所需软件：
Maxent生态位模型软件
(此软件是用Java语言编写的，需Java运行环境，请先去Java官网(http://java.com)下载好)
软件下载网址： http://biodiversityinformatics.amnh.org
（访问该网址需翻墙，评论区有百度云可自提。）
Arc Gis 10.6 软件（美国 ESRI 公司开发的地理信息系统平台）
Office Excel
2.所需输入文件及数据的处理
物种分布数据，即物种的经纬度分布（.csv格式）
如图，在Excel中，将数据分3列，依次为物种名，经度，纬度。保存为.csv格式备用。
（注意：若坐标为度分秒格式需要转换为十进制。可直接在Excel中用公式转，公式：=LEFT(A2,FIND("°",A2)-1)+MID(A2,FIND("°",A2)+1,FIND("′",A2)-FIND("°",A2)-1)/60+MID(A2,FIND("′",A2)+1,FIND("″",A2)-FIND("′",A2)-1)/3600）
环境数据（.asc格式）
世界气候数据网站下载 （http:// www.worldclim. org）可下载到过去、现代、未来的19 个气象数据变量。（下载格式一般为Tif格式，需要转换为asc格式，用转换工具转换；下载范围为全世界范围，可剪裁为研究区域相同。上篇文章已讲如何操作）
除气候因子可添加其他的环境因子。如高程、植被类型、坡度、土壤等。
3.Maxent软件的运行
打开Maxent软件，界面如下（图源网络）。
将2.中的物种分布数据、环境数据文件夹加载进去。再选择预测的结果输出文夹件即可。
一般，刀切法( jackknife)、绘制响应曲线 ( response curves)和制作预测图（make picture of predictions）功能都勾选上。
在Output directory 窗口，选择运算结果存放的目录，点击Browse
（在Projection layers directory/file 窗口，选择不同时间段的气候因子所在目录，气候因子的变量名要与Environmental layers中的环境因子变量名相同，用于预测气候变暖条件下、或者冰期物种分布区的变化。如果没有，忽略此步。）
点开setting（设置），选项设置
一般设置的比较多得是Random seed、Random test percentage和Replicates。
如图，
Random test percentage设置为25，意思是训练集为75%，测试集为 25%。
Replicates 重复 10 次运算，选择 ROC 值最大的一次运算结果进行预测。
点击run预测。
在输出文件夹中，可以查看跑出的结果。
依据 MaxEnt 模型模拟结果，将ASCII 数据导入ArcGIS 软件中，通 过 Conversion 工具转换为栅格数据，再利用Reclassify 工具，对物种的适生区等级进行划分。
具体操作步骤：
在输出文件夹中，可以查看软件跑出的结果。
Maxent的预测结果图在plots文件夹中查看。也可直接打开*.html查看。
1.模型精度检验、环境变量重要性分析
主要通过AUC值衡量MaxEnt模型精度。这里不赘述了，本文主要讲如何制图。
2.适生区分布图的绘制
地图的处理
将地图(*.shp)导入Arcgis 10.6。
双击图标，更改颜色，大小。不需要填充颜色，可直接选择Hollow这个，再进行微调。
添加物种坐标。
如图操作，选择add XY Data。
选择之前保存的物种分布信息.csv。X轴选择经度（longitude），Y轴选择（latitude），点击OK。
双击图标，更改图标的颜色、大小等。右击属性，更改名称为“分布点”。
将ASCII 格式文件转换为栅格数据
ASCII 格式文件不能直接用，需要转为栅格文件，才能进行下步操作。
所需工具：Conversion 工具
Geoprocessing-ArcToolbox - Conversion Tools - To Raster - ASCII to Raster
Input ASCII为Maxent结果文件夹中的ASCII 数据（*.asc）。
output data type一定要选择FLOAT!!!!!!！！
点击OK。
利用Reclassify 工具，对物种的适生区等级进行划分。
Geoprocessing-ArcToolbox -Spatial Analyst Tools - Reclass - Ressclassify
Input raster：选择上一步转换好的栅格文件。
点击Classify：
可以直接用默认的自然间断点法或者自己在画圈处自己手动设定，点击OK。
output raster：选择输出位置，点击OK。
成功后，右击属性（Properties）。
在symbology中调节颜色和label名称。
插入图例（Legend）、指北针（North Arrow）、比例尺（Scale bar）
如图选择Layout View。
最最后！导出地图！
file-Export map即可。
