GEO数据挖掘文章套路生物信息分析

GEO数据挖掘系列文-生信技能树

2018-12-21  本文已影响15人  土豆学生信

GEO数据挖掘系列文-第一期-胶质母细胞瘤
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GEO数据挖掘系列文-第二期-三阴性乳腺癌
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GEO数据挖掘系列文-第三期-口腔鳞状细胞癌
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GEO数据挖掘系列文-第四期-肝细胞癌(WGCNA)
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GEO数据挖掘系列文-第五期-肝细胞癌 (多组差异分析)
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GEO数据挖掘-第六期-RNA-seq数据也照挖不误
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保姆式GEO数据挖掘演示--重现9分文章
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMTEwODk0Ng==&mid=2247486365&idx=1&sn=f6f9a124cc153f2a74a4f85e9cd02ec4&chksm=fa46cea0cd3147b683074e7b47f9cb06f8f81aafea0d20276a1d52653c34c578ae8474f81c17&mpshare=1&scene=23&srcid=1106eCFj0wbH15AP4nx7nxE4#rd

神技能-自动化批量从PDF里面提取表格
生信技能树 https://mp.weixin.qq.com/s/5FJDyd7R7_RV6bWuTK0BRg

纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度
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疑问是前几期的教程为什么没有进行表达矩阵的标准化处理呢?尝试标准化与未标准化的数据对比发现,标准化的数据差异基因表达数量和水平都变弱了。

本系列会持续更新!

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