我要测多少ＸPacBio数据来完成基因组组装项目？

经常遇到的一个问题是，我需要多少Ｘ（Coverage）的数据来完成一个基因组的组装项目。通常你会得到的答案是越多越好。那么多少是比较合适的呢？

今天我们介绍一个PacBio的在线工具：Genome Project Builder。利用这个在线工具，你可以给出拼接的物种的Organism类型。

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接着该系统会为你准备一些基本的技术手册。

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点击“Continue”后，你需要选择DNA样品类型，物种的基因组类型是否为“Inbred”；基因组的大小估计；你的生物信息倾向于使用命令行工具做还是外包给其他的公司做；物种为单倍体，二倍体还是多倍体。

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点击“Continue”后，系统会告诉你该应用包含哪些部分的建议：主要包括样品准备，文库构建，测序，组装和基因组注释。

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点击“Continue”后，该应用会给出你三个选项：一个是将推荐的内容发送至你的邮箱，一个是直接下载至你的电脑中，另一个是可以联系PacBio的客服。

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这里我们选择下载(Download)这个选项。我们会下载一个压缩文件。压缩文件中有五个子文件夹，包括：样品准备，文库构建，测序，组装和基因组注释。接下来我们会介绍这些信息的具体信息。

Reference:

https://www.pacb.com/calculator-whole-genome-sequencing/

https://www.pacb.com/genome-project-builder/