转录组分析流程概述

转录组分析总体流程如图所示，主要分为上游分析（原始数据质量控制、比对、组装、定量），下游分析（差异分析、富集分析）和高级分析（共表达分析、GSEA、时序性分析等）。整个流程图左侧为结构分析（SNV分析、可变剪切分析、差异外显子分析（DEU）及新转录本鉴定），右侧主要为基因表达分析。

随后的文章都是使用GSE176393（SRP323246）进行。
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