GEO在线分析工具

打开方式？

可以在NCBI中打开，有geo datasets 和 geo profiles两种；也可以直接搜索geo打开

geo有哪些数据？

geo存贮了很多芯片及非芯片测序数据。

如何检索？

可以直接在ncbi界面选中geo datasets 然后输入关键词，搜索到的是关于关键词的研究信息；如果在geo profiles中输入关键词，显示的是关于关键词的基因信息。也可以打开geo的主页，在搜索框直接检索，或打开下面的tools或browse content进行搜索。

geo的在线工具能干啥？

选中一个搜索的数据集（dataset）后，最下方有方便计算的在线工具可以帮助分析：两组间差异表达基因；聚类分析、热图；基因在样本间的表达状态。

geo2r是干啥的？

搜索到set后点击Reference Series码，显示这个数据集出自的文章及文章的简要介绍。最下方有个analyze with geo2r的按键，可以进行差异基因、单个样本基因表达水平的分析，还给出了r脚本，可以复制后自己进行修改。