绘图和可视化
信息可视化(也叫绘图)是数据分析中最重要的工作之一。它可能是探索过程的一部分,例如,帮助我们找出异常值、必要的数据转换、得出有关模型的idea等。另外,做一个可交互的 数据可视化也许是工作的最终目标。
matplotlib是一个用于创建出版质量图表的桌面绘图包(主要是2D方面)。
matplotlib支持各种操作系统上许多不同的GUI后端,而且还能将图片导出为各种常见的矢量 (vector)和光栅(raster)图:PDF、SVG、JPG、PNG、BMP、GIF等。
matplotlib API入门
matplotlib的通常引入约定是:
import matplotlib.pyplot as plt
在Jupyter中运行%matplotlib notebook 或在IPython中运行%matplotlib
连续操作IPython中进行简单的应用
普通折线图Figure和Subplot
matplotlib的图像都位于Figure对象中。你可以用plt.figure创建一个新的Figure
fig = plt.figure()
不能通过空Figure绘图。必须用add_subplot创建一个或多个subplot才行
# 图像应该是2×2的(即最多4张图),且当前选中的是4个subplot中的第⼀一个(编号从1开始)
ax1 = fig.add_subplot(2, 2, 1)
matplotlib会在最后一个用过的subplot(如果没有则创建一个)上进行绘制
# bins 设置划分面元(绘制柱状图)
plt.hist(np.random.randn(100), bins=20, color='k', alpha=0.3)
ax2 = fig.add_subplot(2, 2, 2)
# 散点图
plt.scatter(np.arange(30), np.arange(30) + 3 * np.random.randn(30))
ax3 = fig.add_subplot(2, 2, 3)
# 折线图
plt.plot([1.5, 3.5, -2, 1.6])
# cumsum 叠加虚线折线图,同时缩小实线折线图
plt.plot(np.random.randn(50).cumsum(), 'k--')
在一个画布中同时创建柱状图、散点图、折线图(虚线)
“k—“是一个线型选项,用于告诉matplotlib绘制黑色虚线图
plt.subplots,它可以创建一个新的Figure,并返回一个含有已创建的subplot对象的NumPy数组
subplots调整subplot周围的间距默认情况下,matplotlib会在subplot外围留下一定的边距,并在subplot之间留下一定的间距。间距跟图像的高度和宽度有关,因此如果你调整了图像大小(不管是编程还是手工), 间距也会自动调整。利用Figure的subplots_adjust方法可以轻而易举地修改间距:
subplots_adjust参数及说明wspace和hspace用于控制宽度和高度的百分比,可以用作subplot之间的间距。下面是一个简单的例子,将间距收缩到了0
将间距收缩到0颜色、标记和线型
matplotlib的plot函数接受一组X和Y坐标,还可以接受一个表示颜色和线型的字符串缩写。
关闭之前的画图窗口,否则新图会直接画在之前的最后一小部分简便方法
plt.plot(np.random.randn(30).cumsum(), color='k', linestyle='dashed', marker='i')
简单设置参数
非实际数据点默认是按线性方式插值的。可以通过drawstyle选项修改在线型图中,非实际数据点默认是按线性方式插值的。可以通过drawstyle选项修改:
data = np.random.randn(30).cumsum()
plt.plot(data, 'k--', label='Default')
plt.plot(data, 'k-', drawstyle='steps-post', label='steps-post')
通过drawstyle选项修改
设置标题、轴标签、刻度以及刻度标签
fig = plt.figure()
fig.add_subplot(1, 1, 1)
plt.plot(np.random.randn(1000).cumsum())
新的画布
要改变x轴刻度,最简单的办法是使用set_xticks和set_xticklabels。前者告诉matplotlib要将刻度放在数据范围中的哪些位置,默认情况下,这些位置也就是刻度标签。但我们可以通过 set_xticklabels将任何其他的值用作标签
# 设置轴标签
plt.xticks([0, 250, 500, 750, 1000], ['one', 'two', 'three', 'four', 'five'], rotation=30, fontsize='small')
# 设置标题
plt.title('My first matplotlib plot')
# 设置图名
plt.xlabel('Stages')
设置效果
添加图例
plt.plot(randn(1000).cumsum(), 'k', label='one')
plt.plot(randn(1000).cumsum(), 'k--', label='two')
plt.plot(randn(1000).cumsum(), 'k.', label='three')
# plt.legend()来自动创建图例
plt.legend(loc='best')
添加图例
读取文件并显示图表
from datetime import datetime
fig = plt.figure()
fig.add_subplot(1, 1, 1)
data = pd.read_csv('spx.csv', index_col=0, parse_dates=True)
spx = data['SPX']
plt.plot(spx, 'k-')
读取文件并显示图表
图表保存到文件
plt.savefig('figpath.png', dpi=400, bbox_inches='tight')
使用pandas和seaborn绘图
Seaborn简化了许多常见可视类型的创建
线型图
Series和DataFrame都有一个用于生成各类图表的plot方法。默认情况下,它们所生成的是线型图
s = pd.Series(np.random.randn(10).cumsum(), index=np.arange(0, 100, 10))
s.plot()
线性图
该Series对象的索引会被传给matplotlib,并用以绘制X轴。可以通过use_index=False禁用该功能。X轴的刻度和界限可以通过xticks和xlim选项进行调节,Y轴就用yticks和ylim。
DataFrame的plot方法会在一个subplot中为各列绘制一条线,并自动创建图例:
df = pd.DataFrame(np.random.randn(10, 4).cumsum(0),
columns=['A', 'B', 'C', 'D'],
index=np.arange(0, 100, 10))
df.plot()
DataFrame-线形图
柱状图
plot.bar()和plot.barh()分别绘制水平和垂直的柱状图。这时,Series和DataFrame的索引将会被用作X(bar)或Y(barh)刻度。
fig, axes = plt.subplots(2, 1)
data = pd.Series(np.random.rand(16), index=list('abcdefghijklmnop'))
# 水平
data.plot.bar(ax=axes[0], color='k', alpha=0.7)
# 垂直
data.plot.barh(ax=axes[1], color='k', alpha=0.7)
垂直和水平柱状图的比较
对于DataFrame,柱状图会将每一行的值分为一组,并排显示。
df = pd.DataFrame(np.random.rand(6, 4),
index=['one', 'two', 'three', 'four', 'five', 'six'],
columns=pd.Index(['A', 'B', 'C', 'D'], name='Genus'))
df.plot.bar()
按行分组,并排显示
设置stacked=True即可为DataFrame生成堆积柱状图,这样每行的值就会被堆积在一起。
堆积行值柱状图有一个非常不错的用法:利用value_counts图形化显示Series中各值的出现频率,比如s.value_counts().plot.bar()
以有关小费的数据集为例, 假设我们想要做一张堆积柱状图以展示每天各种聚会规模的数据点 的百分比。用read_csv将数据加载进来,然后根据日期和聚会规模创建一张交叉表:
# 加载数据
tips = pd.read_csv('tips.csv')
#获取关键字段
party_counts = pd.crosstab(tips['day'], tips['size'])
# 截取绘图数据
party_counts = party_counts.loc[:, 2:5]
然后进行规格化,使得各行的和为1,并生成图表:
party_pcts = party_counts.div(party_counts.sum(1), axis=0)
party_pcts.plot.bar()
绘制效果
通过该数据集就可以看出,聚会规模在周末会变大。
使用seaborn可以减少工作量。用seaborn来看每天的小费比例:
import seaborn as sns
tips['tip_pct'] = tips['tip'] / (tips['total_bill'] - tips['tip'])
sns.barplot(x='tip_pct', y='day', data=tips, orient='h')
绘制结果
绘制在柱状图上的黑线代表95%置信区间
细化小费组成直方图和密度图
直方图(histogram)是一种可以对值频率进行离散化显示的柱状图。数据点被拆分到离散的、间隔均匀的面元中,绘制的是各⾯面元中数据点的数量。再以前面那个小费数据为例,通过在Series使用plot.hist方法,我们可以生成一张“小费占消费总额百分比”的直方图
tips['tip_pct'].plot.hist(bins=50)
绘制直方图
与此相关的一种图表类型是密度图,它是通过计算“可能会产生观测数据的连续概率分布的估计”而产生的。一般的过程是将该分布近似为一组核(即诸如正态分布之类的较为简单的分布)。因此,密度图也被称作KDE(Kernel Density Estimate,核密度估计)图。
KDE用seaborn绘制
comp1 = np.random.normal(0, 1, size=200)
comp2 = np.random.normal(10, 2, size=200)
values = pd.Series(np.concatenate([comp1, comp2]))
sns.distplot(values, bins=100, color='k')
直方+密度
点图或散布图是观察两个一维数据序列之间的关系的有效手段
加载了来自statsmodels项目的macrodata数据集,选择了几个变量,然后计算对数差
macro = pd.read_csv('macrodata.csv')
data = macro[['cpi', 'm1', 'tbilrate', 'unemp']]
# 对数差
trans_data = np.log(data).diff().dropna()
数据准备
使用seaborn的regplot方法,它可以做一个散布图,并加上一条线性回归的线
sns.regplot('m1', 'unemp', data=trans_data)
plt.title('Changes in log %s versus log %s' % ('m1', 'unemp'))
散点图+回归线
seaborn提供了一个便捷的pairplot函数,它支持在对角线上放置每个变量的直方图或密度估计
sns.pairplot(trans_data, diag_kind='kde', plot_kws={'alpha': 0.2})
数据对比
分面网格(facet grid)和类型数据
数据集有额外的分组维度, seaborn有一个有用的内置函数factorplot,可以简化制作多种分面图
sns.factorplot(x='day', y='tip_pct', hue='time', col='smoker', kind='bar', data=tips[tips.tip_pct < 1])
定义分组维度
除了在分面中用不同的颜色按时间分组,我们还可以通过给每个时间值添加一行来扩展分面网格
sns.factorplot(x='day', y='tip_pct', row='time',col='smoker', kind='bar', data=tips[tips.tip_pct < 1])
拓展分面网格
factorplot支持其它的绘图类型,你可能会用到。例如,盒图(它可以显示中位数,四分位数,和异常值)就是一个有用的可视化类型
sns.factorplot(x='tip_pct', y='day', kind='box',data=tips[tips.tip_pct < 0.5])
盒图