基因注释--Genesymbol转化为EntrezID
2020-03-18 本文已影响0人
淡水鱼Ada
基因的命名有很多种,常见的有GeneSymbol、ENSEMBLID、EntrezID等,为了在不同的基因命名方式之间快速转换,使用OrgDb。
image.png
library(org.Hs.eg.db)
hs <- org.Hs.eg.db
my.symbols <- c("ANKRD62P1-PARP4P3")
select(hs,
keys = my.symbols,
columns = c("ENTREZID", "SYMBOL"),
keytype = "SYMBOL")
# SYMBOL ENTREZID
# 1 ANKRD62P1-PARP4P3 23783