小麦研究

一篇赤霉病关联分析的文章

2017-10-21  本文已影响10人  Neal_Bio
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昨天Neal发的匆忙,没有好好介绍那个fasta小工具。如果以后有什么fasta格式的序列要转换格式,统计信息,fasta文件切割,CDS批量翻译成蛋白质,序列批量反转,序列提取,序列查找等等都可以使用它。所以,一定不要忘了它。

胖丫在群里说,有实验,不远游,游必有方。我们的飞哥接道,所谓游必有方就是试验田一日游啊。我也接道,所谓游必有方就是出游之前给师兄弟交代好实验就可以出去浪了。

今天要推荐一篇赤霉病关联分析的文章,文章发表在Phytopathology上,文章题目是“Genome-Wide Association Mapping of Fusarium Head Blight Resistance in Spring Wheat Lines Developed in the Pacific Northwest and CIMMYT”,通讯作者是Jianli Chen,第一作者是Rui Wang。本文使用170份来自PNW和CIMMYT的春小麦材料,使用小麦90K SNP 芯片和10个非SNP标记(包括与FHB1紧密连锁的标记)。主要在1B,2B,4B,5A,5B和6A上发现显著关联标记,其中在5B上的位点是减少DON含量,而且之前的研究并未见被报道。在这170份材料中,发现14份材料在多个环境下其赤霉病抗性表型良好,而且这些材料并不具有苏麦3号背景,也即没有FHB1基因,可以作为抗赤霉病育种的新种质。

下面是附上摘要和论文部分结果。另外再说下,文章可以在网站http://sci-hub.cc/上下载,输入文章题目或者DOI号即可。

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