批次效应学习

首先是学习优秀的帖子

最近处理数据发现同一个平台的RNA-seq或者芯片数据，不同的样本之间有时候竟然存在很大的差异，也就是所谓的批次效应。因此学习了一下，并推荐一下优秀的推文，主要来自生信技能树、生信星球和果子学生信三个公众号的推文。
到底是批次效应还是真实生物学差异
不同的GSE数据集有不同的临床信息，不同的分组技巧

GSE83521/GSE89143数据集-需去除批次效应

多种批次效应去除的方法比较

校正批次效应

生信技能树论坛的生信基础板块-统计学

GEO 批次效应就靠一个函数搞定

批次效应不得不防

批次效应这样矫正

批次效应有时候真麻烦！

学习使用sctransform去除批次效应

单细胞转录组数据校正批次效应实战（上）

单细胞转录组数据校正批次效应实战（中）

​单细胞转录组数据校正批次效应实战（下）