PAH同一转录本之不同版本的参考序列问题

2018-11-07  本文已影响0人  艺语呢喃er

下午做峰图,发现一个很有意思的案例。

在给PAH基因c.1162G>A位点做峰图时发现,突变点往前7个碱基处,图上是G碱基,但程序提供的参考序列为C,随即上mutalyzer查阅,发现是G;上UCSC查阅,发现是C

mutalyzer结果 UCSC结果

纠结一番,上NCBI下载转录本的参考序列,发现PAH基因同一转录本有2个版本NM_000277.1和NM_000277.2,详细见图,一个为G一个为C。

NM_000277.1图示 NM_000277.2图示

所以,无所谓对错,具体看使用哪个转录本,同步用相应的核苷酸即可。

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