mood： 生日 & 新公司入职的第一天， happy birthday~

来的第一件事，环境配置 & Anaconda学习，记录如下：

1 Anaconda安装

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/Anaconda3-2019.07-Linux-x86_64.sh
sh Anaconda3-2019.07-Linux-x86_64.sh 

2 创建conda子环境

默认安装完环境是base环境，考虑到 python 2.7即将被淘汰，python3.7有的软件不支持，所以创建了一个python 3.6的版本

conda create -n python-3.6 python=3.6

其中-n后面接的是子环境名字，可自主命名，此例中为python-3.6。

查看环境和channel

conda info --env
conda config --show channels

3 进入子环境，安装bioconda库中软件

conda activate python-3.6
conda install -c bioconda bowtie2
conda deactivate

4 更新包、删除包

conda update <packagename>
conda update -n python-3.6 <packagename>
conda remove <packagename>

参考资料： Anaconda简单入门

2020 / 04 / 02 安装bioperl一直装不上，换了中科大的源，成功。参考资料：
annconda换国内源
https://www.datalearner.com/blog/1051522465164324

2020 / 06 / 09 利用yml文件移植环境

# 导出环境配置
conda env export > environment.yml
# 创建环境
conda env create -f environment.yml

参考资料：简书：Anaconda开发环境的自动部署

conda的安装与使用