生信星球培训第五十二期

学习小组Day4笔记--尤少林

2020-04-13  本文已影响0人  FSAE

R与Rstudio的下载与简单使用

  1. 下载
    直接在anaconda软件直接下载R与Rstudio


    Rstudio的操作界面
  2. R包的安装
    2.1 从CRAN安装包
    install.packages()
    这个函数会从你设置的CRAN镜像中下载指定的包的二进制代码并安装到.libPaths()指示的地方。
    2.2. 从Github安装包
    用来从github安装R包的,且用法类似于install.packages(),只需提供包的名字即可,如下代码示例:
#load githubinstall at first
> library(githubinstall)
> install_github('dplyr') #install from github, e.g. dplyr

2.3.从Bioconductor安装包

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite('DavidWebService') #install DavidWebService from Bioconductor

注;R包下载产靠作者:Bio_zouxudong的文章链接:https://www.jianshu.com/p/e217f42f62d1

  1. 包的加载
library()#括号中为所需加载包的名称
  1. Rstudio的基本使用
    4.1 基本算数运算
>1+2
[1] 3

4.2 赋值与运算

>a<-3 #将3赋值于a中
>A<-3+4#将3+4赋值于A(R语言中区分大小写且赋值)
>rm(a)#删除变量a
>rm(a,b)#删除变量a与A

4.3 清空控制台
Ctrl+L

  1. 用Rproject管理工作目录
    所谓工作目录就是默认的读取和储存位置,也就是说,R语言只能和一个文件夹进行互动,这个文件夹非常重要,做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑,找不到。查看这一篇,养成好习惯:
    https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA(参靠至生信星球学习)
  2. 查看当前工作路径,与修改工作路径
>getwd()
>setwd()
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