学习小组Day3笔记——Benjamin
2020-09-09 本文已影响0人
亲爱的本杰明
Linux环境下的软件安装
Linux怎么安装软件
conda ：Linux系统的应用商店
在服务器上下载conda或者conda的精简版miniconda
- 在搜索引擎搜索miniconda
2. 查看自己服务期的配置uname -a
3. 对应自己的服务器位数，在刚刚的官网下载最新版的miniconda，或者其它版本，复制相应链接
4.在服务器的自己想要的安装目录下使用wget 刚刚复制的链接进行下载miniconda
5. 安装成功后，source ~/.bashrc，成功
添加镜像
# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
常用命令
- 查看软件列表：
conda list - 搜索conda软件
conda search 软件名 - 安装软件：
conda install fastqc -y - 卸载软件：
conda remove fastqc -y - 查看当前环境：
conda info --envs - 创建环境：
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y - 激活环境：
conda activate XXX - 退出环境：
conda deactivate
Linux安装软件.png
