MonaGO：一款新颖的交互式富集分析web工具

Monash Gene Ontology (MonaGO) 是一种新颖的基于 Web 的可视化系统，它提供了一个直观、交互式和响应式的界面，用于执行 GO 富集分析和可视化结果。MonaGO支持基于DAVID富集结果可视化，或者直接输入GO terms进行可视化。

网址：https://monago.erc.monash.edu/

支持以下三种形式：

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一、提交GOterms直接可视化

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可以手动粘贴或者上传csv文件，格式只有三列：GO terms、P值、该term相关基因，注意基因直接用;号间隔

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提交文件之后，左下角可以选择允许的最大P值或者手动输入

选择距离测量:可以通过下拉菜单选择距离测量。这就是如何比较GO术语之间的相似性，以便对相似的术语进行聚类。这里有三个选项;首先是“Number of overlapping genes”，这是GO术语中共有基因的百分比。第二个选项"Resnik similarity between GO terms"和“Simrel between GO terms”是两个GO术语之间的语义相似性度量。

点击提交，即可产生交互式界面

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主界面是一个弦图，它附加了辅助的可视化元素，包括GO术语标签和分层聚类树。标签中使用前缀代表GO数据库三个分支，如BP(生物过程)、CC(细胞成分)和MF(分子功能)。

鼠标指定GO trem上时候，右侧面板会显示出相应的细节信息，已经该GO term的Hierarchy结构信息，点击save image可以保存相应的图形。

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Details信息上方有搜索框，可以输入GO term或者Gene ID 进行快速检索

二、提交MonaGO的输出文件

可以下载存储主和弦图的当前状态的JSON文件，并上传以获得恢复。可视化界面中点击Export File可以输出monago格式文件，方便后续上传修改。

三、使用DAVID结果

MonaGO可以输入genes list并通过DAVID服务器得到富集结果并可视化，可看到与David功能界面大体一致。

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总的来说操作并不复杂，不失为富集结果可视化的一种替代方式，感兴趣的可以试一下~~