统计三代fastq测序数据里的reads长度范围
2021-11-20 本文已影响0人
小明的数据分析笔记本
fastq格式 使用 seqkit这个工具
seqkit帮助文档的链接
https://bioinf.shenwei.me/seqkit/usage/#stats
命令
seqkit stats -a N01.filt.fq.gz -T
返回结果
image.png
指标还挺多的 主要就是为了看N50
image.png
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命令
seqkit stats -a N01.filt.fq.gz -T
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指标还挺多的 主要就是为了看N50
