在github上安装包出现需要安装Rtools的问题

library(devtools)
install_github("phyloseq")

install.packages("Rtools")
source("https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/")
biocLite(" ")

options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
install.packages('installr')
library(installr)
install.Rtools()
library(stringr)
install.packages("stringr") 

PATH="{PATH}"
以上代码均无法安装Rtools，可能由于外网网速原因。
然后从官网手动下载巨慢。

最后用linux端下载Rtools.exe进行了手动安装按照以下官网的流程配置，最终Rtools安装成功。
附上Rtools40-x68_64百度网盘链接：
https://pan.baidu.com/s/12MZqHyOolCZW9xRtnAoXPA
提取码：8nfr

writeLines('PATH="${RTOOLS40_HOME}\\usr\\bin;${PATH}"', con = "~/.Renviron")
Sys.which("make")
install.packages("jsonlite", type = "source")