生信R学习与可视化

最近整理了几类常用的绘图代码

2022-03-16  本文已影响0人  沉迷工作的我

最近比较忙,所以有段时间没有更新了,后面多多更新,再补过来! 之前整理了关于热图的绘图代码,包括常规热图,和个性化加标签的热图,刚好最近有小伙伴说能不能整理几个常用的绘图代码,想学习一下。

我统计了下大家对于绘图的一些要求,重新写了几个R绘图脚本:(1)常规热图,(2)相关性网络图,(3)添加指定标签的complex热图,(4)相关性热图和相关性点图。以上的绘图代码,都是封装好的绘图函数,拿来就可以用,还有绘图用到的案例数据,以及画出来的案例图片。那我们先看看画出来的效果吧。

常规热图(可以支持自定义添加行列注释)

heatmap.png

相关性网络图

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添加指定标签的热图(可以自定义添加注释,和显示指定的行名)

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相关性热图(可以选择相关性计算方法pearson, spearman,可以根据指定p值阈值来添加星号(可以是任意字符),字体大小,颜色调整,是否显示对角线...)

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相关性散点图

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需要以上绘图代码的小伙伴,vx: InfoStudio01。

image.gif 图片
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