如何利用GEO，TCGA数据库研究新型冠状病毒受体ACE2的表达
2020-03-09 本文已影响0人
小鸡快跑2008
随着新型冠状病毒疾病（COVID-19）疫情发展逐渐得到有效控制，科学家对病毒的研究也有了很大进展。
据报道新型冠状病毒就是通过Spike蛋白与人ACE2蛋白的结合进入细胞内部，所以ACE2蛋白或将成为研究新型冠状病毒的突破口。
那问题来了，ACE2蛋白主要在哪些细胞表达？ACE2蛋白的表达与哪些因素有关？
浙江大学吴超发表的《Single-cell RNA expression profiling of ACE2, the putative receptor of Wuhan 2019-nCoV, in the nasal tissue》基于公开的GEO数据库单细胞RNA-Seq数据集GSE122960，分析了呼吸道不同位置组织中的ACE2 RNA表达谱。结果表明ACE2表达出现在鼻上皮细胞中。
图1
南加大公卫学院环境健康科学部的Guoshuai Cai撰写的《Tobacco-use disparity in gene expression of ACE2, the receptor of 2019-nCov》利用GEO，TCGA数据库挖掘的方法找到了ACE2的表达相关因素
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