统计-实验设计中,该怎么设置重复?

2018-06-07  本文已影响0人  PriscillaBai

实验设计的重复分两种:技术重复(technical replicate)和生物重复(biological replicate)。

1. 技术重复:

同一个样本,重复三次。此时样本量=1

技术重复

2.生物重复:

取多个样本,进行多次实验。此时样本量=3

生物重复

该选择哪种重复?

1. 最理想的设计是兼顾技术重复和生物重复,但是由于资金的限制,只选生物重复也可,如RNA-seq。

2. 在研究一个个体时选择技术重复,在研究一个组时选择生物重复。

特殊情况,如两个样本有相关性(双胞胎)怎么办?

有效样本量=样本量/ 1+(样本量-1)*相关系数

如:两个样本相关系数=0.7     有效样本量=2/ 1+(2-1)*0.7=1.18

存在相关性的样本
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