V3-V4测序引物

341F：CCTACGGGNGGCWGCAG
805R：GACTACHVGGGTATCTAATCC

zcat FA1_R1.fastq.gz |head -n 100|grep CCTACGGG[AGCT]GGC[AT]GCAG

F引物.png

zcat FA1_R2.fastq.gz |head -n 100|grep GACTAC[^G][^T]GGGTATCTAATCC

R引物.png

V4-V5测序引物

F:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA
R:CCGTCAATTCMTTTRAGTTT

grep GTGCCAGC[AC]GCCGCGGTAA

2021-05-12 21-57-15屏幕截图.png

grep CCGTCAATTC[AC]TTT[AG]AGTTT

2021-05-12 21-57-57屏幕截图.png

V4测序引物

F：GTGYCAGCMGCCGCGGTAA
R：GGACTACHVGGGTWTCTAAT

grep GTG[TC]CAGC[AC]GCCGCGGTAA

2021-05-15 10-39-23屏幕截图.png

grep GGACTAC[^G][^T]GGGT[AT]TCTAAT

2021-05-15 10-40-16屏幕截图.png