导--细胞遗传学正常的中国急性髓系白血病患者的突变谱及相关临床特

来自医学基因组学国家重点实验室、上海血液学研究所副研究员陈冰于2018年发表在International Journal of Laboratory Hematology的文章Mutation profile and associated clinical features in Chinese patients with cytogenetically normal acute myeloid leukemia

摘要

导言：细胞遗传学正常的急性髓系白血病（CN-AML）占AML患者总数的近一半，是AML的高度异质性子集。CN-AML的具体遗传特征和种族特征值得研究。
方法：采用深度测序技术检测152例中国CN-AML患者39个基因的突变模式，并分析其临床特征。
结果：145例（95.4%）患者共检测到39个基因的503个突变，平均每个病例3个突变。9个基因（NPM1、CEBPA、DNMT3A、GATA2、NRAS、TET2、FLT3、IDH2和WT1）在超过10%的患者中发生突变。髓系转录因子、激活信号和DNA甲基化的功能组受影响最大。复发基因的变异等位基因频率（VAF）在不同功能组中的分布不同。CEBPA和GATA2的高突变率以及FLT3-ITD的低突变率似乎是中国患者的显著特征。此外，发现CEBPAbi和GATA2在M2亚型中突变最多，而NPM1和DNMT3A在M4和M5中突变更多。预后分析确定CEBPAmo突变为次要因素。选择FLT3-ITD、TP53、DNMT3A、CEBPAmo和WT1突变作为高危标记物，以识别预后不良的CN-AML患者。
结论：本研究为中国CN-AML患者的民族遗传特征和临床相关性提供了有价值的信息。

介绍

急性髓系白血病（AML）是一种临床和生物学上的异质性疾病。数十年的细胞遗传学和分子研究揭示了发病机制的基因异常，并产生了分子诊断和预后评估系统，特别是在应用下一代测序（NGS）技术之后。由于癌症基因组图谱（TCGA）小组已通过全基因组（WGS）或全外显子组测序（WES）在200例AML患者中识别出23个显著突变的基因，在几个大型AML队列中研究了突变模式和相对预后评估，进一步提高了诊断的准确性。

突变模式在不同人群中呈现一定的异质性。例如，TP53突变与复杂的核型和不良预后高度相关，10例继发性AML显示更多ASXL1突变和IDH2、TET2和DNMT3A突变的发生率随年龄增加而增加。值得注意的是，由于观察到正常核型（细胞遗传学正常AML，CN-AML）患者中NPM1和DNMT3A等几个驱动基因的突变频率更高，因此CN-AML中的突变分布可能是特殊的。

对于预后预测，欧洲白血病网络（ELN）和国家综合癌症网络（NCCN）等公认的国际风险分层系统更依赖细胞遗传学异常，以及NPM1、CEBPAbi、FLT3-ITD和TP53突变来区分一些低风险或高风险患者。在ELN和NCCN风险分类中，约50%核型正常（CN-AML）的AML患者被分为中等风险组，这实际上包括缺乏精确预后指导的高度异质性患者。因此，CN-AML的突变模式以及精细的临床和预后相关性需要阐明。

此外，血液系统恶性肿瘤中分子标记分布的种族差异；例如，与西方人群相比，中国B细胞急性淋巴细胞白血病患者的t(9;22)/BCR-ABL1的频率更高，t(12;21)/ETV6-RUNX1的频率更低，亚洲慢性淋巴细胞白血病患者的3q和18q gain更为常见。CN-AML突变谱的种族差异也值得研究。

利用target深度测序策略，我们在这里报道了对152例中国CN-AML患者基因突变的综合研究，旨在深入了解独特的基因图谱和更好的风险咨询，并为临床实践提供有价值的信息。