WaferGen ICELL8 单细胞分选建库仪

2015年2月份，Wafergen公司开发ICELL8 Single-Cell System单细胞分选平台 :

• 每次运行可分离500~1800个细胞
• 细胞的捕获效率大约37%
• 细胞适用范围为5-100um
• 样本通量为8（一枚ICELL8芯片上一次最多可以分析8种细胞样品）
• 没有整合试剂，使用Takara试剂，需进行试剂优化
• 自动成像技术系统：可实现单细胞反应孔可视化
• 单细胞挑选软件：只挑选活的单细胞进入后续的处理，从而可以节约反应试剂，缩短数据分析时间（分注细胞到“活的单细胞”判定耗时30分钟）
• 应用灵活：支持客户定制应用（如全长转录组、TCR分析）

WaferGen ICELL8 单细胞分选建库仪

1. ICELL8cx™ Single Cell System应用领域

• SMART-seq 全长转录组分析
• ATAC-seq
• T细胞受体分析和5'端差异表达
• 3' 端差异表达

SMART-seq原理链接

2. ICELL8cx™ Single Cell System技术原理

ICELL8cx™ Single Cell System技术原理

2.1 芯片分注系统

ICELL8cx Chip十分小巧，只有4平方厘米，其中搭载有5184个微孔（每个微孔中都固着有特异性标记的核酸探针）

ICELL8cx Chip

将细胞稀释至1cell/50nl的细胞悬液，Icell8cx通过钢针吸取细胞悬液，准确的对芯片上搭载的5184个微孔进行50nL的分注，细胞的分注遵循泊松分布，理论上最多可以获得1800个单细胞。

芯片分注

另外，一次可分注8种样品，分注在15分钟左右即可完成，由于钢针的孔径较大，分注操作不受细胞大小的影响，能够对5-100μm的细胞均一分注，包括细长的心肌细胞，为了保证如此微量的体积不会挥发，芯片底座具有冷却装置以及仪器内设有加湿器以便维持着合适的温度和湿度，确保细胞的“安全”。

2.2 自动成像技术系统（Imaging Station）

Imaging Station将整个芯片分为6x6的区域，共计144个，移动相机实现双通道光源切换（Hoechst/PI）对每个孔进行拍照，可以得到各个微孔的图像，整个成像阶段需15min。

芯片成像

2.3 单细胞挑选软件

细胞在喷注之前经过hoechst和PI染色，使用专用的CellSelect软件能够对得到的图像数据中各微孔内的细胞数进行判读，可自动判断细胞的生死。由于只有被选择的细胞才可以进入后续的处理，从而可以节约反应试剂，缩短数据分析时间，节省NGS分析成本。

单细胞挑选软件