vcf文件绘制进化树
2023-03-19 本文已影响0人
花生学生信
使用SV文件：
将所有样本整合，
ls * > all.txt
合并样本：
SURVIVOR merge all.txt 1000 2 1 1 0 30 sam.vcf
构建系统发育树：
~/tools/VCF2Dis-master/bin/VCF2Dis -i sam.vcf -o dis.mat
矩阵文件生成树文件：
ATGC: FastME (atgc-montpellier.fr)
选择矩阵
画树：itol
