群体遗传学

进化树在线制作工具iTOL教程(1):基本操作

2020-09-13  本文已影响0人  周小钊

使用界面

与Evolview一样,可以注册后使用,也可以白嫖,点击upload即可上传树文件

基本操作

右侧controls负责对进化树进行修改:

basic主要负责修改树的造型、分支、标签,还有标签的字体、字号是否加粗等

advance主要负责展示bootstrap的特征

iTOL最好用的一个功能是能修改局部的label和leaf

当我们鼠标悬停在某个位置时,我们可到这个局部数据的信息


鼠标点击即可修改局部node的属性,比如我改一下颜色和风格,可以看到局部的node被改为红色虚线,局部的label也可以更改


在选好节点后,再点击color>new color range,我们可以把一部分label和branch加入背景色

然后我再将S26添加到h1中,点击相应的node,选择color>add to existing即可,去掉的话选择remove from即可

点击h1的cover,可以选择背景色出现在label、clade、full上,也可以关闭,我选一下full

border负责加边框,0就是不加,在这里我加一个1px的边框展示下

鼠标悬停在label上时,我们也可以修改局部label的属性,我在这里修改了label的名字

导出

点击export,可以看到支持不同类型文件的导出

当colored ranges lenged点击on时,会出现图例

以上便是利用iTOL进行进化树美化的一些基本操作,相比起evolview,iTOL使用起来更加方便。


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