2021-06-24 点亮RNA
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点亮RNA,让RNA看得见,不仅便于我们分析RNA在细胞中的分布与含量,甚至可以观察RNA在细胞内的动态变化。以往针对RNA的可视化,我们一般采取的策略是FISH或者RNA aptamer招募的荧光蛋白,今天分享的这项研究则是开发了一种荧光RNA(也是一种RNA aptamer)结合新型染料,实现多色RNA可视化技术。与RNA aptamer招募荧光蛋白进行RNA可视化不同,荧光RNA是直接与染料结合,其背景更低。

三言两语
1. 研究者针对HBC染料,采取SELEX方法筛选能够与HBC特异结合的RNA patamer,命名为Pepper。Pepper本身并不能发荧光,而是在与HBC结合后才能产生荧光。因此,通过将Pepper融合进目标RNA中,即可实现对目标RNA的可视化。(PS. Peper像灯芯,HBC是火!)
2.Pepper+HBC可以实现RNA的可视化,通过改造HBC,可进一步获得产生不同发射波长的染料。
3.将Pepper融合进CRISPR/Cas9系统的sgRNA中,可以实现sgRNA靶向的DNA的可视化。
Reference
Chen, X. et al. Visualizing RNA dynamics in live cells with bright and stable fluorescent RNAs. Nature biotechnology 37, 1287-1293 (2019).