AI 如何编辑单细胞热图呢
2020-06-14 本文已影响0人
caokai001
参考：
如下图所示：
image.png
使用pheatmap 获得每一个细胞reads 分布情况，我们常常保存为pdf. 但是我感觉蓝色颜色不正，导入AI里面感觉变淡了。【用pheatmap 设置blue,画出的图感觉不蓝，加深颜色，效果好看一些】
下面是探索如何用AI进行编辑单细胞track热图
实践
Step 1 ：从R里面导出pdf 格式热图，每一行是一个细胞read 分布图（图中展示是特定基因区域）
image.png
Step2 : 直接拖拽到AI 里面
发现画板宽度不够
image.png
拓宽画板
image.png
效果如图：
image.png
Step3 : 编辑热图pdf 文件
我此时发现，没办法进行编辑pdf 颜色了，尝试了一下嵌入功能，结果可行【可能过程会卡机-&*】
image.png
接下来就可以调色哦
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修改图中颜色为深蓝色
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Step4 ： 效果比较图
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Step5 :将图片插入到IGV，比较bulk ChIP-seq 和signal cell ChIP-seq 效果一致性：
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