AI 如何编辑单细胞热图呢
2020-06-14 本文已影响0人
caokai001
参考:
如下图所示:
image.png
使用pheatmap 获得每一个细胞reads 分布情况,我们常常保存为pdf. 但是我感觉蓝色颜色不正,导入AI里面感觉变淡了。【用pheatmap 设置blue,画出的图感觉不蓝,加深颜色,效果好看一些】
下面是探索如何用AI进行编辑单细胞track热图
实践
image.pngStep 1 :从R里面导出pdf 格式热图,每一行是一个细胞read 分布图(图中展示是特定基因区域)
Step2 : 直接拖拽到AI 里面
发现画板宽度不够
image.png
拓宽画板
image.png
效果如图:
image.png
Step3 : 编辑热图pdf 文件
我此时发现,没办法进行编辑pdf 颜色了,尝试了一下嵌入功能,结果可行【可能过程会卡机-&*】
接下来就可以调色哦
image.png
修改图中颜色为深蓝色
image.png image.png
image.pngStep4 : 效果比较图
image.pngStep5 :将图片插入到IGV,比较bulk ChIP-seq 和signal cell ChIP-seq 效果一致性: