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质谱流式细胞技术简介

2021-10-19  本文已影响0人  Seurat_Satija

中文名:质谱流式细胞技术

外文名:Mass Cytometry

技 术:流式技术

区 别:标签系统的不同

技术优势:通道数量增加到上百个

 基本概念:

质谱流式细胞技术(Mass Cytometry)是利用质谱原理对单细胞进行多参数检测的流式技术。它继承了传统流式细胞仪的高速分析的特点,又具有质谱检测的高分辨能力,是流式细胞技术一个新的发展方向。

基本原理:

传统流式细胞技术和质谱流式细胞技术相比,主要有两点不同:第一、标签系统的不同,前者主要使用各种荧光基团作为抗体的标签,后者则使用各种金属元素作为标签;第二、检测系统的不同,前者使用激光器和光电倍增管作为检测手段,而后者使用ICP质谱技术作为检测手段。

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质谱流式细胞技术原理

如图中所示,用金属标签抗体标记的细胞进入质谱流式细胞仪后,逐个通过ICP质谱检测装置,然后对每个细胞中各种金属标签进行定量检测,进而得知每个细胞中各目标蛋白的含量[1] 。

技术优势:

荧光基团发射光谱一般比较宽,其间往往会发生重叠,会带来一些问题:一方面限制了检测通道的数量(<20个);另一方面,它会带来严重的串色问题,很多通道的信号需要复杂的补偿计算。由于利用ICP质谱作为检测手段,与传统流式细胞技术相比,质谱流式细胞技术具有以下优势[2] :

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荧光基团发射光谱(上)与原子质量谱(下)的比较

 第一、通道数量增加到上百个

质谱流式细胞仪中的ICP质谱装置具有非常宽的原子量检测范围(88~210Da),因此可以同时检测上百个不同的参数。

第二、通道间无干扰,无需计算补偿

ICP质谱具有超高的分辨能力,可以完全区分开用来标记的各种元素(如右图所示)。实验数据表明,其相邻通道间的干扰<0.3%,基本可以忽略不计,无需计算补偿。这样不仅使实验流程得到简化,也节约了标本和试剂。

 第三、金属标签数量多,并具有极低的背景

用来作为标签的金属元素在细胞中的含量极低,而金属标签与细胞组分的非特异性结合能力极低,所以信号的背景极低。目前用来标记抗体的金属标签有30多种,随着技术进步,更多元素可以用来作为标签,其种类会进一步增加。

第四、多样化的数据处理方式,实现对样品的深入分析[3] 。

质谱流式细胞仪通道数量的激增带来信息量的成倍增长。传统的流式分析方法已经不能完全满足需要,所以需要对数据进行各种降维处理,提取出其中包含的有用的生物学信息。常用的分析方法有:SPADE、PCA、viSNE以及Gemstone等。

 应用领域:

质谱流式细胞技术可以实现对细胞群体进行精准的免疫分型,对细胞内信号传导网络进行全面的分析,分析细胞亚群之间的功能联系,以及对于大量样品的高通量多参数检测。在造血、免疫、干细胞、癌症以及药物筛选等多个领域的研究有着广泛的应用前景[4-5] 。

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人骨髓细胞的精细免疫分型

 发展现状:

目前,质谱流式技术还处于起步阶段,美国DVS Sciences公司研发的质谱流式细胞仪已经发展到第二代,即CyTOF2 质谱流式细胞仪(CyTOF2 Mass Cytometer)。

参考资料

1. Bendall, S.C., et al .Single-cell mass cytometry of differential immune and drug responses across a human hematopoietic continuum. :Science ,332(6030) :P687-96 .

2. Bendall, S.C., et al .A deep profiler's guide to cytometry : Nat Biotechnol. ,30(7) :p. 639-47. .

3. Turn high dimensional data into revolutionary knowledge. .dvssciences [引用日期2013-09-7] .

4. Bendall, S.C. and G.P. Nolan . From single cells to deep phenotypes in cancer. :Nat Biotechnol. ,30(7) :p. 639-47. .

5. Make the complex routine. .dvssciences [引用日期2013-09-7]

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