ITS测序数据上传SRA
2020-07-12 本文已影响0人
聆听小倩
注:不同类型数据上传不同数据库,此处微生物多样性的上传SRA。测序报告书上有。
https://mp.weixin.qq.com/s/CUGkuaNnAZZ3W5IpPyaS-A
具体步骤看上边链接
以下是弯路和细节补充:
官网NCBI,注册,注册完一定要去邮箱信息激活!!
页面点击My submission,下拉可以看到SRA三个字,点进去。new submission.
接下来分为8个步骤。
第一步就是信息注册。
第二步你已经有bioproject和biosample了吗,我没有,选择NO。释放时间随意。后来可以再data management中查看
第三步描述一下,类似于论文题目摘要,简短点。
第四步类型:此处选择metagenome and environmental sample
第五步,容易报错。样本名字自己起,加一列ID 123456……!!! 其他的按照上边链接填写 例如soil metagenome等
第六步按照上边链接填写。我第一次没按照上边填写,报错了。双端,filenme filename2填上。我的Nts1.1 .fq 另一端Nts1.2.fq。原始数据raw.split.fq要按照这个重新命名。双端后缀.1. .2.区分一下
上传数据,我是用的傻瓜上传。就是网页上点击下载了Aspera软件,然后,点击上传,所有数据一起shift一起选中上传了。我的总共4g,上传用了1小时。