LncExpDB：深挖lncRNA表达谱的数据库

LncExpDB：https://bigd.big.ac.cn/lncexpdb

LncRNA通过复杂多样的分子机制发挥重要调控功能，在多个生物学过程以及疾病发生发展中均发挥重要作用。由于很强的组织特异性与功能多样性，提示lncRNA的实验设计将不同于蛋白编码基因。

LncExpDB提供了9大生物学场景（正常组织/细胞系、器官发育、植入前胚胎发育、细胞分化、亚细胞定位、外泌体、癌症细胞系、病毒侵染、昼夜节律）的表达谱系统分析，包括鉴定特征lncRNA基因（管家基因／组织特异性基因、差异表达基因、节律基因、动态表达基因、亚细胞区室富集基因），高表达的lncRNA及高表达的生物学状态，相互作用靶基因。

数据库主页－9种生物学场景

由于lncRNA通常表达量很低，如需进行实验研究，预先了解其可能高表达的生物学状态是非常重要的。

表达潜能页面

9种生物学场景中的特征lncRNA，也就是有潜在生物学功能的lncRNA有哪些呢？作者们也都采用不同方法分析，在库中展示了相关基因。

特征基因页面

特征基因的总览页面中的表格一目了然，一个lncRNA可能在哪些生物学场景发挥作用。

当然，这些重要的特征基因，会和哪些mRNA发生相互作用呢？这里的相互作用主要通过共表达获得。

与TUG1共表达的蛋白表达基因

列出了每组共表达关系出现的生物学场景，可能是cis（位于同一条染色体）还是trans（不在同一条染色体）的调控关系。

很有用的表格，如果能提供搜索结果的下载就更好了！

看视频，了解更多关于数据库的内容和使用方法。

视频地址：https://bigd.big.ac.cn/education/tutorials/lncexpdb