KEGG富集分析又不能做了？

2023-04-02 本文已影响0人生信交流平台

前面粉丝反馈过，KEGG富集分析一直报错，得不到结果。小编第一时间跟大家分享了解决办法。

今天又有粉丝反馈KEGG报错

小编尝试安装了最新版本的R version 4.2.0 (2022-04-22 ucrt），然后用BiocManager安装了clusterProfiler包，显示版本为clusterProfiler_4.6.2

BiocManager::install("clusterProfiler")

然后试了一下自带的例子

library(clusterProfiler)
data(geneList, package='DOSE')
de <- names(geneList)[1:100]
yy <- enrichKEGG(de, pvalueCutoff=0.01)
head(yy)

发现除了一些警告信息意外，是可以得到结果的。

小伙伴们可以自己尝试一下。
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