bioperl安装（无需root权限）
2018-06-12 本文已影响484人
加油gjq
bioperl安装流程：
-
bioperl 安装（cpan）
- perl -MCPAN -e shell 一路回车，安装完成后q退出
source ~/.bashrc
>cpan
cpan>install Module::Build
cpan>o conf prefer_installer MB
cpan>o conf commit
cpan>q
- 下载bioperl(wget https://github.com/bioperl/bioperl-live/archive/master.zip)并解压：unzip master.zip
- 进入解压后的目录安装
perl Build.PL --install_base=~/perl5/Bioperl/ 指定安装目录，可自行修改
./Build test
./Build install
中间一直敲回车即可，若无报错，则安装完成
-
blastxml安装
- 下载blastxml(wget http://search.cpan.org/CPAN/authors/id/C/CJ/CJFIELDS/Bio-SearchIO-blastxml-1.70.tar.gz)并解压
- 进入解压后的目录安装
perl Makefile.PL --install_base ~/perl/lib/perl/Bio/SearchIO/
make
make install
