R语言应用(1):离线安装R包以及依赖包
2018-11-29 本文已影响31人
魚晨光
前言
由于网络安全、访问国外镜像网站速度较慢等原因,无法在线安装R包以及依赖包,成为困扰R 用户(包括笔者在内)的一个问题。于是最近上网查询了一下相关的解决办法,并且实现了离线安装R包以及依赖包,具体方法如下,希望对大家有所帮助。
方法
1)下载所有R包到本地
#linux 终端(或windows cmd窗口)
$ cd /work/software/R/contrib
$ wget -c ftp://cran.r-project.org/pub/R/src/contrib/*.tar.gz
2)将所有下载的R包相关信息写到配置文件
#R 终端
path <- c("/work/software/R/contrib")
write_PACKAGES(path,type="source")
3)写一个安装R包的脚本
为了方便批量安装多个R包,于是写一个简单的R脚本,install_Rpkg.R 脚本代码:
library(tools)
args=commandArgs(T)
if(length(args) == 0 ){
cat("Usage: Rscript install_Rpkg.R package1 package2 package3 ...")
cat("\n")
quit("no")
}
path <- c("/work/software/R/contrib")
install.packages(args, contriburl=paste("file:",path,sep=''),type="source")
4)安装R包
使用示例:
$ Rscript install_Rpkg.R ggplot2
* installing *source* package ‘ggplot2’ ...
** 成功将‘ggplot2’程序包解包并MD5和检查
** R
** data
*** moving datasets to lazyload DB
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
*** copying figures
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded
* DONE (ggplot2)
更新'.Library'里的HTML程序包列表
Making 'packages.html' ... 做完了。