相似性分析---------不能尽信教程

2020-11-27  本文已影响0人  阿酒88

相似性分析可以使用如下这个高集成函数,作图高大上

用法仅需两行:

library(PerformanceAnalytics)

chart.Correlation(all[,2:10], histogram=TRUE, pch=19,method="spearman")

数据格式:

结果输出:

这个软件包人气比较旺,在各大可视化教程均可以看见它的身影,但是图例左上角的* 解释就不那么一致了。

教程一(错误的解释):

在这里简单介绍一下这个图怎么去看:

里面的点,代表每一个样本,*代表显著性,***代表p小于0.01,图中的数值则为相关性

教程二(错误的解释):

提取了实际的 pvalue,核对后改说法均不正确:

R包源码:

#borrowed from printCoefmat

Signif<-symnum(test$p.value,corr=FALSE,na=FALSE,

cutpoints=c(0,0.001,0.01,0.05,0.1,1),

symbols=c("***","**","*",".",""))

根据源码:

.是pvalue 小于0.1大于0.05

1星是pvalue 小于0.05大于0.01

2星是pvalue 小于0.01大于0.001

3星是pvalue 小于0.001

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