转录组综合分析包TomicsVis | 最终还是有人做了!!!!
2023-07-18 本文已影响0人
小杜的生信筆記
写在前面
这个包最终还是有人做了，前面的微生物中Wen Tao&Yong Xin Liu在Protein & Cell IF 21.1中发表了The best practice for microbiome analysis using R建立了基于R语言微生物分析代码库EasyMicrobiomeR包。此包也是很收纳了微生物中使用的R包和分析代码。对于微生物分析同学来说确实是很实用。
现在对于转录组的分析，又有大佬整合了相关的分析，常使用的分析代码和流程也收纳在里面。作者也提供了详细的流程，详情可以到包的帮助文档中查看。
EasyMicrobiomeR
论文网址：https://academic.oup.com/proteincell/advance-article/doi/10.1093/procel/pwad024/7147618?login=false
GitHub仓库：https://github.com/taowenmicro/EasyMicrobiomeR
可实现的功能
转录组分子综合包TOmicsVis
Github仓库：https://github.com/benben-miao/TOmicsVis
帮助文档：https://benben-miao.github.io/TOmicsVis/
可实现的功能
总结：常规分析是可以的完成的，预计作者后续还会不断增加。
往期文章：
1. 最全WGCNA教程（替换数据即可出全部结果与图形）
2. 精美图形绘制教程
小杜的生信筆記，主要发表或收录生物信息学的教程，以及基于R的分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!!
