在线绘制带颜色标注的大脑脑区图

导读：大脑是人体最为复杂的器官之一，由多个功能特化的脑区构成。每个脑区承担着特定的生理和认知功能。通过应用定量数据映射技术，将数值以色彩编码的形式呈现于各个脑区，可以显著增强对不同脑区定量信息的视觉识别和理解。

《bioRxiv》文章“Multifaceted impact of specialized neuropeptide-intensive neurons on

the selective vulnerability in Alzheimer’s disease”fig 3A的大脑脑区切面图（medical sagittal view）展示了随着年龄的增长，阿尔茨海默病相关神经肽（Alzheimer’s disease-associated neuropeptides，ADNPs）在4个脑区中表达降低。AMY：杏仁核（amygdala），CNG：前扣带脑皮质（anterior cingulate cortex），HIP：海马体（hippocampus），BA9：前额叶皮层9（Frontal cortex 9）。

主要的大脑脑区及其功能

前额叶（Frontal Lobes）：

负责高级认知功能，如决策、规划、注意力、个性和社交行为

运动和语言功能也部分位于此区域。

顶叶（Parietal Lobes）：

处理触觉和本体感觉（身体各部分的位置和运动）

参与空间感知和视觉信息的处理。

颞叶（Temporal Lobes）：

与听觉处理、语言理解和记忆形成有关。

颞叶的海马体是长期记忆形成的关键区域。

枕叶（Occipital Lobes）：

主要负责视觉信息的处理

岛叶（Insula）：

与内脏感觉和情绪处理有关。

扣带回（Cingulate Cortex）：

参与情绪、注意力和疼痛感知

基底神经节（Basal Ganglia）：

控制运动和协调

小脑（Cerebellum）：

协调运动和维持身体平衡

下丘脑（Hypothalamus）：

调节体温、食欲、睡眠和内分泌系统

脑干（Brainstem）：

连接大脑和脊髓，控制呼吸、心跳等基本生命功能

这些脑区通过复杂的神经网络相互连接，共同协作，使大脑能够执行其复杂的功能。每个脑区都包含大量的神经元，它们通过电信号和化学信号相互沟通。

1，打开作图URL

https://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_cerebro_colormap_115

2，示例数据

点击图片上方的示例数据，下载，并使用excel打开。

示例数据包括2列：

第1列是脑区缩写。必需来自示例excel第二个sheet第一列所给的30个脑区名。

第2列是各个脑区的数值。若输入多列数值，则会展示多个图。

3，输入检查

示例数据：点击输入框下面的“示例”按钮，将载入示例数据。

真实数据：数据放在excel中，调整好后，Ctrl+A选中数据，Ctrl+C拷贝，Ctrl+V粘贴数据到输入框中。

然后使用输入框下面的“输入检查”按钮先对输入数据进行检查。若检查不通过，请根据检查提示重复【修改-输入检查】步骤，直到检查通过（如下图所示），然后可以继续选择参数。

注：输入检查是新加功能，它会根据不同模块的输入要求，逐行逐列检查输入数据，并给出提示，确保数据符合模块输入要求。

4，选择参数

颜色：设置了低中高三种颜色。低的数值以绿色表示，高的数值的红色表示，中间的值以黄色表示。渐变颜色

是否绘制legend color：是否绘制代表数值的颜色条

是否绘制样品名：仅一列数值时，可以选择不绘制。多列数值时，选择绘制

是否标注各个脑区名字：是否以箭头的形式标注感兴趣脑区的名字缩写。

字体：设置了期刊杂志中最常用的两种字体：Times New Roman和Arial。如需使用其他字体，可以下载pdf或者svg图片，然后使用acrobat illustrator进行替换或者添加文字

5，提交出图

检查通过，并且参数选好后，点击“提交”按钮，约3s后，会在页面上显示彩色的脑区图。我们提供了pdf、svg两种矢量图，600 dpi的png标量图供大家下载使用。可以使用acrobat illustrator等软件编辑矢量图，进行组图，调整文字位置，添加说明等操作，以满足个性化需求。

结果说明：该图为数据映射到exterior（大脑表面）的视图，同时提供了数据映射到sagittal（切面）的视图（见最后一张图）。

如果选择标注名字并且有多列样品的数值，则会同时以两种视图方式绘制多张图片，colorbar范围根据所有列数值范围设定。

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