测序饱和度评估
2020-06-12 本文已影响0人
Peng_001
测序饱和的意义
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测序深度和基因组覆盖率为正相关关系。

一般测序深度选择在10X。(人基因组为3G,但一般序列测序文件大小为30G,加上其他内容,一个人至少要100G)
测序不饱和的影响
- 对DNA 序列来说,测序不饱和,影响拼接。
- RNA-seq 定量不准。
- 宏基因组不能准确反映物种组成。
测序深度和基因组覆盖率为正相关关系。
一般测序深度选择在10X。(人基因组为3G,但一般序列测序文件大小为30G,加上其他内容,一个人至少要100G)