简书·六六_ryx· 的学习笔记汇总（方便学习）2018-09-05 本文已影响58人 热衷组培的二货潜 第1篇：ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同 第2篇：原始数据的质控、比对和过滤 第3篇：用MACS2软件call peaks 第4篇：对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估（一）——phantompeakqualtools 第5篇：对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估（二）——ChIPQC 第6篇：重复样本的处理——IDR 第7篇：用Y叔的ChIPseeker对peaks进行注释和可视化 第8篇：用网页版工具做功能分析和motif分析 第9篇：差异peaks分析——DiffBind 第10篇：ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析
