RNA velo
2022-02-18 本文已影响0人
Bellon
摘取片段作为自己做笔记的一个备忘，全文看出处（周运来大佬写的）
什么是RNA 速率（RNA velocity）
RNA速率能够通过叠加剪接信息来推断细胞分化的方向性。
随着令人震惊的发现，未剪接和剪接的mRNA丰度可以在标准的单细protocols胞中进行区分，La Manno等人(2018)引入了RNA速度(RNA velocity)的概念。通过将测量结果与潜在的mRNA剪接动力学联系起来，探索定向轨迹的推断：特定基因的转录诱导导致(新转录的)前体未剪接mRNA的增加，而相反，转录的抑制或缺失导致未剪接mRNA的减少。因此，通过将未剪接的mRNA与成熟的剪接mRNA进行区分，可以近似地得到mRNA丰度的变化，即其时间导数，即RNA速度。跨mrna的速度组合可以用来估计单个细胞的未来状态。细胞的运动是通过将速度投影到低维嵌入中来实现的。
作者：周运来就是我
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来源：简书
