Shiny Server安装
2020-09-15 本文已影响0人
JeremyL
#为什么要使用Shiny Server
Shiny Server使用户可以在网络上托管和管理Shiny应用程序。Shiny是一个R包,运用反应式编程模型
简化Web程序开发。Shiny Server可以通过不同的URLs 和端口管理不同的R程序。
使用Shiny Server的好处有:
- 同时托管多个应用程序,每个应用程序都有自己的URL。
- 支持不支持WebSocket的Web浏览器,包括Internet Explorer 8和9。
- 用户能够开发和管理自己的Shiny应用程序。
- R进程崩溃或终止并不影响下一个用户请求该应用程序。
Shiny Server专业版(Shiny Server Professional)有跟多的功能:
- 确保您的应用程序受到保护,并且只能由经过身份验证的用户访问。
- 一个Shiny应用程序可以支持多个用户同时访问。
- 通过使用Web仪表板监视Shiny应用程序的性能和使用情况,可以深入了解它们。
- 使用SSL对发送到应用程序和从应用程序获取的数据进行安全加密。
- 了解和管理当前和历史应用程序资源利用率,以更好地配置和优化应用程序。
- 通过根据并发会话数配置多进程Shiny应用程序,微调专用于应用程序每个用户的资源。
- 使用运行状况检查端点监视Shiny Server的运行状况。
#系统要求
Shiny Server当前仅能在Linux 操作系统运行,并且只支持64位系统:
- RedHat Enterprise Linux(和CentOS)6及更高版本
- Ubuntu 14.04及更高版本
- SUSE Linux Enterprise 12及更高版本
我们目前仅支持x86-64体系结构。
#安装
Shiny Server安装之前需要先安装 R 和Shiny 包。
- R 安装
Shiny Server建议安装R版本3.0或更高版本。 安装最新版本的R,应首先按照以下说明将CRAN存储库添加到系统中: - Debian: https://cran.rstudio.com/bin/linux/debian/
- Ubuntu: http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu/README.html
$ sudo apt-get install r-base
注意:如果您没有按如上所述添加CRAN Debian或Ubuntu存储库,则此命令将安装与您当前系统版本相对应的R版本。可能是老版本的R。
- Shiny包安装
$ sudo su - -c "R -e \"install.packages('shiny', repos='http://cran.rstudio.com/')\""
或者
$ R
>install.packages('shiny')
>library("shiny")
- 安装gdebi(用于安装Shiny Server及其所有依赖项)和Shiny Server。
$ sudo apt-get install gdebi-core
$ wget https://download3.rstudio.org/ubuntu-14.04/x86_64/shiny-server-1.5.14.948-amd64.deb
$ sudo gdebi shiny-server-1.5.14.948-amd64.deb
Shiny Server将会被安装到/opt/shiny-server/,主要的执行程序在/opt/shiny-server/bin/shiny-server。
- shiny-server命令
#启动
$ sudo systemctl start shiny-server
#停止
$ sudo systemctl stop shiny-server
#重启
$ sudo systemctl restart shiny-server
#查看状态
$ sudo systemctl status shiny-server
#服务器重新初始化,但不会中断服务器当前进程或任何连接。
$ sudo systemctl kill -s HUP --kill-who=main shiny-server
$ sudo reload shiny-server
#shiny-server状态
$ sudo systemctl status shiny-server
- 查看shiny-server
打开浏览器输入: http://IP:端口/
HTTP
IP:使用ip addr
查看
端口默认:3838。
- shiny-server配置
shiny-server 配置文件
/etc/shiny-server/shiny-server.conf
/opt/shiny-server/config/default.config
$ vi /etc/shiny-server/shiny-server.conf
# Define the user we should use when spawning R Shiny processes
run_as shiny;
# Define a top-level server which will listen on a port
server {
# Instruct this server to listen on port 3838
listen 3838;
# Define the location available at the base URL
location / {
#### PRO ONLY ####
# Only up tp 20 connections per Shiny process and at most 3 Shiny processes
# per application. Proactively spawn a new process when our processes reach
# 90% capacity.
utilization_scheduler 20 .9 3;
#### END PRO ONLY ####
# Run this location in 'site_dir' mode, which hosts the entire directory
# tree at '/srv/shiny-server'
site_dir /srv/shiny-server;
# Define where we should put the log files for this location
log_dir /var/log/shiny-server;
# Should we list the contents of a (non-Shiny-App) directory when the user
# visits the corresponding URL?
directory_index on;
}
}
# Setup a flat-file authentication system. {.pro}
auth_passwd_file /etc/shiny-server/passwd;
# Define a default admin interface to be run on port 4151. {.pro}
admin 4151 {
# Only permit the user named `admin` to access the admin interface.
required_user admin;
}