Evidence of selection signatures that shape the Persian cat breed

2016 年发表在 Mammalian Genome 上。通讯作者是美国爱荷华州立大学 Department of Animal Science 的 Max F Rothschild，第一作者为 Francesca Bertolini。

研究可以分为三步：

1. 扫描波斯猫基因组上的长纯合片段 ROH；

2. 选出波斯猫有、而其他品种的猫没有的纯合片段；

3. 选出波斯猫的纯合片段中与其他品种分化最大的区域，在波斯猫衍生品种中进行单倍型分析。

选出了四个 H>0.7 的纯合区域，这些区域都长约 1 Mb，其中三个是波斯猫特有的，而在波斯猫衍生品种中单倍型不那么保守。此外，两个在人类中与脸型决定有关的基因，CHL1 和 CNTN6，在检测到的单倍型区域上，因此是决定波斯猫短脸性状的 candidate 基因。

只用纯合程度来检测选择信号？

为什么要在衍生品种中分析呢。看上去是为了研究波斯猫受到了选择的基因组对于由它衍生出的这些猫中的影响。讨论里说研究进一步确认了这些品种的波斯猫血统？此外还写道，在脸不短衍生品种中，CHL1 和 CNTN6基因（与脸型有关的）所在的纯合片段区域就有更多的单倍型（如前文所述，不那么保守）。