【科研猫·出品】TCGA超大批量生存分析教程
上一期的教程【科研猫】生存分析的正确姿势（1）视频+R代码分享，给大家讲解了批量对TCGA中的基因进行生存分析的第一步。教大家如何通过cBioportal去下载TCGA中的数据和患者的表型数据，然后通过R语言做了一个生存分析的KM图。
最近很多同学都在催我们啦，何时出第二季，何时教大家进行批量的生存分析。被催到脸红了呀，实在是羞愧，最近团队给接了太多数据分析的项目。【小编插话：每天跟这些晚期强迫症技术要稿子，我容易嘛我。。。】
大部分科研的套路都是从一个表型出发，筛出一个有意义的基因，然后对其进行深入的挖掘和功能实验。但是如何才能筛选到真正重要的目标基因呢？这个问题困扰着很多人。作为一名临床科研工作者，如果一个分子能够跟患者预后扯上关系，那么文章的档次立刻就上来了。如果我们能分分钟完成数百上千个基因的生存分析，那么以后的“筛基因”“找靶点”是不是就有了指路明灯了呢？有木有一点小激动呢~
经过我们科研猫团队生信分析团队的数日辛苦劳作，我们完成了全网首个批量进行TCGA生存分析的程序，只要输入你想分析的基因列表，下载相关肿瘤的数据文件，运行代码即可。我把这个程序命名为Survival_Analysis_Terminator.R，没错又是“Terminator系列”，为什么命名为“终结者”呢？因为有了这个代码，终结所有相关问题，无需求助其他软件。
为了演示，我在这里提交了500个基因，总运行时长仅3分多钟！是不是很心潮澎湃嗯？先来看个操作演示视频，这次配了音效，还挺燃的呢~
【科研猫】TCGA批量生存分析-代码-教学视频
代码运行后，会生成如下的三个结果文件：
1） 1.LogRank.Pvalues.csv，包括500个基因的生存分析Log-rank test的P值。
2） 2.Kaplan-Meier_plots.pdf，500个基因的KM图。你没看错，是一个500张高清矢量大图的pdf文件。
3） 3.KM_plots_with_significant_Pvalues文件夹，这个文件夹中包括数据所有log-rank test之后P值显著的所有基因的KM图，是tiff格式，方便大家写文章使用，可直接放到paper里面。
这三个文件和文件夹的截图如上图所示。所有分析都是自动化完成，无需修改任何代码。
为了完成这个代码，【科研猫】的整个生信团队付出了诸多心血，要知道这样的一个代码，就可以作为某些小型生物公司数据分析服务的技术核心。包括之前的所有代码和教程（GEO数据库挖掘、功能富集分析气泡图等），如果外包给公司做成case，每次分析费用至少2000+。懂行的小伙伴纷纷夸赞咱们公众号良心！
可是，让人气愤的是，不少同学反映网络上出现了多个盗版科研猫的教程。由于教程和代码都是免费获取的，竟然有人随便换个抬头就堂而皇之地转手高价出售（淘宝和微信已各警告过一家，请侵权者好自为之；再若盗版，必追究法律责任）。还有小白同学竟然来问，咱们不收费是不是因为是盗版！
盗版也就算了，盗版发了之后没有答疑，不会解答大家的疑问，导致很多同学在学习过程中屡屡受挫乃至怀疑起咱们的代码来。着实坏了我们“科研猫“的招牌，实在让人心累。因此，和我们的生信团队反复讨论后，我们决定从技术部拨出来部分人力提供网上教程答疑服务。
另外，仰仗各位同仁转发朋友圈一直是咱们公众号的主要推广方式，但由于交际环境的复杂，渐渐考虑到全部可见的诸多不便，经反复考量和商议，综合此次代码的高含金量：
此次采用付费服务的方式，初步仅定价298元，具体服务打包如下：
市价5000元的批量生存分析代码和教学视频；为期3个月VIP答疑服务
生信分析师1对1技术指导及支持；100元生信分析优惠券（有效期2年）
提供试剂/服务费发票（专票/普票均可，15日内寄出）
科研猫的推文怎么会没有福利呢？看到这篇半个广告贴，会不会有点失望，
不会！不能！绝不要！
福利通道
1）推文投稿：一经审核发表，该代码免费赠送；但凡对诸位科研同道有所裨益之论，皆可投稿，具体事宜，联系客服小姐姐（下方二维码）。
2）凡与科研猫所属 上海腾云生物科技有限公司 ，进行过合作、委托过数据分析及论文合作者，免费赠送。（需提供发票或合作合同）
3）凡转发过【科研猫】公众号往期推文，保留至今未删除者，可享受8折。（需大于15日）
4）朋友圈打卡集赞，全部可见，集满30赞，可享受7折。
欲购买该套分析套餐的同学，赶紧联系咱们折耳猫小姐姐吧。
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