[目录]哈医数据库⑦miRNA targets、NSDNA

2019-07-01 本文已影响14人郑宝童

1.哈医数据库①Lnc2Cancer、Lnc2Meth、LncACTdb、MSDD
2.哈医数据库②miRSponge、Co-LncRNA、FACER
3.哈医数据库③LncMAP、LNCat
4.哈医数据库④CellMarker、GPA
5.哈医数据库⑤TIP、SEECancer
1-5.哈医数据库①-⑤小结Lnc2Cancer、Lnc2Meth、LncACTdb、Co-LncRNA、Lncmap、LncCat等数据库
6.哈医数据库⑥LnChrom、DiseaseEnhancer

16.miRNA targets
- 简介：神经系统疾病相关的（实验支持的）ncRNA数据库

在该文的研究中，他们提出了一种多步骤方法，通过结合来自16种癌症的数千种TCGA肿瘤的转录组和临床数据来优化与预后相关的关键miRNA-target 互作。我们发现预后相关的关键miRNA-target相互作用与癌症转移密切相关。

统计
文章获得了总共1,956个预后相关的关键miRNA-target互作(16种TCGA癌症类型中的112种miRNA和1,443种靶基因)。

17.NSDNA
- 简介
  NSDNA:The Nervous System Disease NcRNAome Atlas,是一个手动管理的数据库，提供全面的神经系统疾病（NSD）和ncRNA之间的实验支持关联。当前版本的NSDNA记录了14种物种中的144种NSD和8736种ncRNA之间的26128种关联，由1410篇文章组成。
- Nervous System Diseases （NSDs）是影响中枢和外周神经系统的一组疾病，包括脑，脊髓，颅神经，外周神经，神经根，自主神经系统，神经肌肉接头和肌肉的紊乱。
- Noncoding RNAs （ncRNA）是功能性RNA分子家族，其包括miRNA，lncRNA，siRNA，snoRNA和piRNA等。有证据表明，ncRNA可促进多种NSD的进展。

What Can Users Do in NSDNA?

-Browse实验支持的ncRNA-NSD关联数据;
-Search ncRNA-NSD associations by ncRNA/species/disease/tissue;
-Link NSD和ncRNA相关的数据库;
-Download 所有实验支持的ncRNA-NSD关联数据;
-Submit novel entries into the NSDNA database提交新条目到NSDNA数据库.

Using NSDNA for Your Research

-研究ncRNA 和 NSD的关系;
-探索NCRNA在NSD中的功能和分子机制;
-解读ncRNA介导的NSD调节网络;
-识别新的NSD生物标志物和药物靶标.

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