ASreml VS WOMBAT-文献解析
2019-04-03 本文已影响0人
育种数据分析之放飞自我
ASreml VS WOMBAT-文献解析
参考文献
Waheed A, Khan M S. Computing genetic parameters and breeding values in Nili-Ravi buffaloes – experiencing Wombat and ASREML software[J]. Pakistan Journal of Zoology, 2009, 9:587-592.
摘要
abstract
这篇文章的主要目的是为了比较ASreml和WOMBAT两个软件在计算遗传参数中的特点，数据采用了单性状动物模型，数据有1534个，系谱数据有1702个，固定因子为：herd, year, season，估算305-day的产奶量的遗传力。
示例数据：
前三列是系谱数据
图片.png
WOMBAT示例代码
wombat
ASreml示例代码
asreml
分析结果
result
结果可以看到，两者BLUP值估计大体一样，但是ASreml给出了BLUP的标准误，而WOMBAT没有给出。
结论
- ASreml比WOMBAT处理数据和编写代码更简单
- ASreml 比WOMBAT更容易收敛
