R绘图生信分析NGS数据分析-20210421

过表达敲低RNAseq找靶基因分析思路讨论

2021-01-20  本文已影响0人  纪伟讲测序

    凡是做分子机制的研究,必做分子(mRNA/lnc/circ/miRNA/piRNA ...)的过表达敲低实验,观察细胞/动物表型改变,说明分子的功能。那么我们要找该分子的下游调控通路,比如该分子调控了下游哪个分子,通过哪个信号通路呢?

    确定表型有改变的,而下游分子可能性很多,不确定是哪一个,怎么找?先做个RNAseq看看吧,文献一般是这样做的,我们也认为这样是可行的。那么做RNAseq(全基因表达谱实验)到底能不能找到靶标。找靶标的分析思路是什么?

    如何展现这个基因的强大功能,比如调控了很多周期,免疫,增值等相关的基因,或者功能。深入研究之后,会发现,能出的东西很多。 

    本期我们一起探讨,确定分子有表型后,做RNAseq的数据分析,及图表展示,靶基因确定的思路。


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